Московский семинар по биоинформатике - 17 февраля 2011

С.А.Вакуленко, О.Радулеску

Генетические сети со сложным устойчивым поведением

Четверг, 17 февраля 2011, 18.00
Институт молекулярной биологии (Вавилова, 32), к. 309.
С.А.Вакуленко*, О.Радулеску

Санкт-Петербургский гос. университет технологии и дизайна, Институт проблем машиноведения РАН (С-Петербург); Montpellier II University (Montpellier, France)


Будут рассмотрены генетические сети специальной структуры, которые как мы полагаем, могут описывать взаимодействие между микроРНК и факторами транскрипции. Такие free scale структуры возникают в результате естественной эволюции. Мы покажем, что динамика сетей порождает сложные аттракторы и бифуркации; нетривиальная бифуркация возможна в результате мутации в одном гене; с другой стороны, возможно, что мутации во многих генах не влияют на структуру аттрактора. Структуры, образованные такими сетями, могут быть устойчивы под влиянием больших флуктуаций морфогенетических полей


S.A.Vakulenko*, O. Radulescu

Genetic networks with complex robust behaviour

We consider gene networks of a special structure, which, as we believe, can describe, for example, an interaction between microRNA and transcription factors. Such a structure of free scale type can appears, in a natural way, as a result of the preferential attachment evolution.
We show that
1) network dynamics can generate complicated attractors; bifurcations can result from mutations in a single gene; on other hand, even mutations in many genes sometimes do not affect attractor;
2) patterns generated by these networks can be robust even large morphogen variations.